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微生物菌剂在农业可持续发展中发挥着重要作用，具体包括以下几个方面：

提高产量：微生物菌剂能够提供农作物所需的营养元素，并分泌植物生长调节物质，如赤霉素、细胞分裂素和生长素，刺激、调节和促进作物的生长发育，从而有效增加农作物的产量。

改善品质：施用微生物菌剂后的农产品，其蛋白质、糖分、维生素、氨基酸等有益成分含量明显提高，农产品的籽粒或果实更加丰满光滑，蔬菜果品色泽更加亮丽，既美观又营养，因此价值更高。同时，一些微生物肥料产品还能减少硝酸盐的积累，提升农产品的安全性。

增强抗逆性能：微生物菌剂中的有效菌种具有分泌抗生素类物质和多种活性酶的功能，能够抑制或杀灭致病菌，从而降低病害的发生，并增强作物的抗逆性能。这意味着作物更能够抵御干旱、低温、倒伏、病害以及盐碱等不利环境的影响，同时有效预防作物的生理性病害发生。

促进土壤健康：微生物菌剂的施用有助于改善土壤微生物群落的结构和功能，增加土壤中有益微生物的数量，提高土壤的通气性和保水性，改善土壤的物理性质。这些有益微生物能够分解有机质，释放植物生长所需的营养元素，促进土壤有机质的积累，从而增强土壤的肥力和健康状况。

降低化肥农药使用量：微生物菌剂的应用能够提高土壤中有机质的利用率，增加农作物对养分的吸收利用效率，从而减少对化肥的需求。同时，微生物菌剂中的有益微生物能够降解土壤中的残留农药，降低化学农药的使用量。

综上所述，微生物菌剂在农业可持续发展中具有促进土壤健康、提高作物产量和品质、减少化肥农药使用量等多方面优势，为农业的可持续发展提供了强有力的科技支撑。